Clasificación del “orden” Stromatoporida
Coincidiendo con la extinción masiva de finales del Devónico, se produce un cambio radical en la morfología del esqueleto de los estromatopóridos. Hasta entonces, estos organismos segregaban un esqueleto de naturaleza calcítica o aragonítica sin espículas. Sin embargo, tras la extinción, los pocos representantes del grupo pasan a presentar una microestructura fibrosa, con espículas silíceas, pero adoptando el mismo nivel de organización que sus parientes pre-devónicos.
De este modo, hay dos modos de abordar la clasificación de este grupo. El primero sería considerar a las formas pre-devónicas como un grupo taxonómico independiente y monofilético, no relacionado con los organismos post-devónicos y mesozoicos, siendo los rasgos comunes fruto de la convergencia y, por tanto, análogos. Aquellos fósiles post-devónicos, aunque llamados estromatopóridos, serían en realidad representantes de otras clases de poríferos que adoptaron este nivel de desarrollo. El segundo enfoque obligaría a rechazar el significado taxonómico del grupo. Tomando el esqueleto de los estromatopóridos como un carácter convergente, sin relación filogenética real, estos fósiles constituirían un grupo polifilético que sólo representa un nivel de organización, el llamado grado estromatoporoideo, caracterizado por módulos que comprenden sistemas superficiales y esqueletos basales hipercalcificados. Estos esqueletos aparecerían en diferentes estirpes de esponjas para estabilizarse sobre sustratos firmes.
Sea como fuere, si nos atenemos a la clasificación de los estromatopóridos paleozoicos, previos a la extinción del Devónico, podemos clasificarlos, basándonos en sus elementos macroestructurales, a saber, las láminas, pilares y placas vesiculares, así como en la microestructura de dichos elementos, en los siguiente siete órdenes: Labechiida, Clathrodictyida, Actinostromatida, Stromatoporellida, Stromatoporida, Syringostromatida y Amphiporidos.